黄瓜花叶病毒丹参株系外壳蛋白基因的克隆和序列分析The Cloning and Sequence Analysis of Coat Protein Gene of Cucumber Mosaic Virus Isolate from Salvia Miltorrhiza Bge
吴志明,温春秀,彭卫欣,吴智红,王云逸,谢晓亮
摘要(Abstract):
从河北安国具有典型花叶症状的大田丹参叶片中分离到病毒病原 ,经过生物学接种、电镜观察和酶联免疫吸附测定表明该离物与CMV有较近的亲缘关系 (记为CMV DS)。从叶片中提取了该病毒的总RNA ,按照CMV外壳蛋白 (CP)基因前后保守区序列 ,设计合成了 1对特异引物 ,采用RT PCR法扩增了 780bp的全长CP基因的cDNA序列 ,将其克隆到pGEM T载体上 ,并进行序列分析。结果重组克隆序列长为 778bp ,含 1个开放阅读框架 (ORF) ,长度为 65 7nt,编码 2 1 8个氨基酸组成的蛋白。与国内外报道的CMV株系序列比较 ,CMV DS和亚组Ⅰ株系的核苷酸序列和氨基酸序列的同源性为 93 3%~ 99 4%和95 9%~ 1 0 0 % ;而与亚组Ⅱ株系的核苷酸和氨基酸序列同源性仅为为 78 4%~ 79 0 %和81 2 %~ 83 0 % ,表明CMV DS与CMV亚组Ⅰ的株系较亚组Ⅱ株系同源关系更密切 ,将其划归为CMV亚组IB中 ,这是首次在丹参上发现的CMV株系。
关键词(KeyWords): 丹参;黄瓜花叶病毒;外壳蛋白基因;克隆;序列分析
基金项目(Foundation): 河北省科技攻关项目 ( 0 3 2 2 0 111)资助
作者(Author): 吴志明,温春秀,彭卫欣,吴智红,王云逸,谢晓亮
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DOI: 10.16318/j.cnki.hbnykx.2004.02.006
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